El presidente de la Corte Superior de Justicia de Junín representa al Poder Judicial en el Distrito Judicial del Junín. Es elegido el primer jueves del mes de diciembre, cada dos años y en votación secreta por los Jueces Superiores Titulares de la respectiva Corte, los cuales se reúnen en sesión de Sala Plena.

La presidencia de la Corte Superior de Justicia de Junín, está al mando del Dr. Cleto Marcial Quispe Paricahua; para el periodo 2023 - 2024.